Методика ИКСИ позволила исправить две конкретные клинические проблемы: сперма с патологическими изменениями (например, низким количеством сперматозоидов, плохой подвижностью сперматозоидов, высоким процентом сперматозоидов с патологической морфологией, высоким уровнем антиспермальных антител в сперме) и неудачные попытки оплодотворения, проведенные ранее, в циклах классического ЭКО при нормальных оценочных показателях спермограммы. В этом случае инъецироваться будут только те ооциты, которые достигли полной стадии созревания (метафаза II).
Некоторые ооциты (около 2%) неизбежно повреждаются во время проведения инъекции и не предназначаются для дальнейшего оплодотворения. Примерно 70% из инъецированных морфологически отобранных сперматозоидов приводят к результативному оплодотворению и наступлению беременности. Последующие этапы деления бластомеров такие же, как при экстракорпоральном оплодотворении.
ИКСИ является необыкновенно эффективным инструментом, который позволил многим парам, у которых число сперматозоидов минимально, или у которых сперматозоиды были взяты из яичка или придатка, успешно получить доступ к вспомогательным репродуктивным программам. Методика также имеет важное значение для оплодотворения криоконсервированных ооцитов. Во многих клинических условиях, когда образец спермы, собранный в день извлечения яйцеклетки, не подходит, возможно, как это предусмотрено в соглашении, подписанном парой, сделать ИКСИ в условиях, в которых он был первоначально предложен IVF.